植物病理实验室2为多功能实验室，主要面向植保、动植物检疫专业开展综合性实验、创新性实验及操作性强的实验。课程包括普通植物病理学、种子病理学、免疫学、检验检疫技术、普病综合大实验和植物保护学通论等。

实验室结合培养室提供植物抗病材料筛选、植物病害接种、症状观察、病原观察、植物抗病性鉴定、病程观察、病原菌越冬场所调查等实验。

主要仪器设备包括显微镜、高速冷冻离心机、电子天平、微波炉、酸度计、电泳仪、凝胶成像系统、蛋白检测仪、恒温振荡器、超净工作台、培养箱等。